O IFCE incentiva os servidores públicos federais a ele vinculados a se capacitarem em cursos de nível de pós-graduação. Para tanto, realiza as seguintes ações:

1. Captação de parcerias com outras instituições ofertantes de cursos de pós- graduação, celebração de acordos com estas para a realização da capacitação;
2. Intermediação com outras instituições para realização de pós-graduação para servidores;
3. Análise e comprovação de regularidade das instituições nas quais os servidores realizam pós-graduação.

Cursos e instituições contratadas:

• Mestrado Profissional em Avaliação de Políticas Públicas - Parceria com a Universidade Federal do Ceará;
• Mestrado Acadêmico em Educação Agrícola - Parceria com a Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro;
• Doutorado em Geografia - Parceria com a Universidade Federal do Ceará;
• Doutorado em Ciências Marinhas Tropicais - Parceria com a Universidade Federal do Ceará;
• Doutorado em Design - Parceria com a Universidade Estadual de Minas Gerais;
• Doutorado em Letras - Parceria com a Universidade Federal do Ceará;
• Doutorado Interinstitucional em Engenharia de Alimentos - Parceria com a Universidade Federal de Santa Catarina;
• Doutorado Interinstitucional em Engenharia de Teleinformática - Parceria com a Universidade Federal do Ceará;
• Doutorado Interinstitucional em Física - Parceria com a Universidade Federal do Rio Grande do Norte.